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1. 选用和培育抗菌的饲料作物品种
不同的饲料作物品种对霉菌的敏感性不同，因此培育抗菌性品种，可使饲料作物受霉菌侵染的几率大幅度下降。这也是防霉的根本途径，而生物基因工程逐步扩大应用，使培育抗性品种切实可行。
2. 选择适当的种植或收获技术
试验结果表明，从花生分离到的黄曲霉有80%—90%能产生毒素，远远高于从其他作物分离到的黄曲霉。所以在连续种植花生的田块里的花生，黄曲霉污染率高，黄曲霉毒素(AF)的含量也高，破碎的花生易污染黄曲霉，也有利于毒素的生成，故如果采取轮作等种植技术和适当的收获方法将可大降低霉菌和霉菌毒素的污染。另外，收获和储运过程中应尽量避免虫咬、鼠啃、、磨压，避免玉米、花生等谷物的表皮和外壳损伤；破碎的籽粒应除去，因为这样的籽粒往往被高度污染。
3. 严格控制饲料和原料的水分含量
引起饲料霉变的三个主要条件是湿度、温度和氧气。如果我们能控制这三个条件之一，即可有效地防止霉变。一般情况下，把水分控制在安全线以下是最简便易行的方法，故作物收获后应迅速将其干燥，且必须保证干燥均匀一致。稻谷中的水分宜控制在13%以下，玉米在21.5%以下，花生在8%以下。
4. 改善贮藏条件，抑制霉菌生长
料霉变大部分是在贮藏过程中发生的，因此贮藏过程中的防霉是饲料防霉的重要环节。
4.1 物理防霉法
主要有控制贮藏环境的温度、封闭隔氧贮存、气调贮藏、低温通风贮藏以及辐射法等。据介绍，将脱粒后的湿玉米装入内衬塑料袋的麻袋，尽量装满并扎紧袋口，此后因为玉米本身的呼吸作用，消耗了袋中的氧，不仅黄曲霉难以生长，其他霉菌也可受到抑制，是经济简便、很有前途的防霉方法。国内现在常用低温通风贮藏法，采取低温与机械通风相结合，使饲料达到安全水分含量。不仅适用于颗粒饲料，而且对水分含量较高的粉料应用效果也较明显。随着辐射食品技术的发展，应用辐射处理饲料的研究和应用也在不少国家发展起来。
4.2 化学防霉法添加防霉剂：
此法比较适合饲料工业。作为饲料防霉剂必须既有抑制霉菌作用，又要对人畜无害且价廉，使用方便、可靠。常被用作防霉剂的有丙酸及其盐类、山梨酸及其盐类、双乙酸钠、乙氧喹、延胡索酸、胱氢醋酸盐、龙胆紫、富马酸二甲酯等。目前世界饲料工业用防霉剂耗量大的是丙酸及其盐类，其次是山梨酸及其盐类乙酸。利处理：乙酸利的主要作用是抑制AF的生物合成。将乙烯利酸配成9%—15%的水溶液，取其相当新鲜花生量35%的液重，与花生充分搅拌混合，于28—30摄氏度、相对湿度100%的环境中贮存于聚乙袋中，90日内仍无AF的生物合成。
4.3 微生物抑制法
日本永森食品公发现7种能吞噬黄曲霉和抑制AF产生的微生物，但尚未见到实用的报道。
4.4 综合法
酶和抗氧化剂作为防霉剂，是近几年来国际上出现的新型高效防霉剂。它的作用原理与化学防霉剂的防霉原理不同，它是以外加酶取代霉菌体内的酶系，并以抗氧化剂阻碍霉菌正常的氧气吸收，从而阻碍霉菌正常的生理功能达到防霉效果。所使用的酶，要较霉菌体内的酶强1—500倍，作用于霉菌时，菌体内的酶就遭到破坏，发生变性，使霉菌不能从饲料中吸取营养，再加上抗氧化剂的作用，霉菌得不到充足的氧气，从而抑制其生长。这种防霉剂对霉菌来说不会产生抗性，而且使用安全可靠，对外界无不良影响。
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